蚵寮鱼港为台南市北门区附近沿海低洼地区，地形上受外伞顶洲之遮蔽，冬、夏季平均潮差约1公尺，海象温和。此渔港是利用海岸沙洲后侧之舄湖水域或盐田鱼塭间之排水道就地兴建，土壤盐份含量较高，多开发为鱼塭及盐田。港域狭小，水深不足，稍大型船只必须等候潮始能进出。