台东地区因有太平洋洋流与黑潮调节气候，加上不曾受到严重的环境污染与破坏，自古以来即有多种药草植物生长。日治时期，日本人曾在台东知本与太麻里一带山区种植药草，并发展成「药山」，除了少数是引进的物种，绝大多数都是台东地区（包括兰屿）的原生种药草。据药草专家统计，台东地区所拥有的药草种类高达2000多种，可说是「台湾药草的故乡」。 

台东原生应用植物园就是在这样的背景下诞生的，虽然开幕才短短两年的时间，但台东原生应用植物园以其专业的经营团队以及卓越的经营管理理念，在台湾的后山地区，创造了一处结合药草栽植、生技研究、鲜蔬美馔、养生休闲与推广保健产品的观光游憩植物园区。 

入口处是一气势惊人的水幕大厅，彷佛要洗去游客的一身尘嚣。进入园区后，放眼望去是一片广达1500坪、种满各式药草与花卉的「原生探索植物园」，分为保健药草、香氛植物、药膳植物、地被性植物、百草茶植物及水生植物等六大区，共有二百多种物种，全部都是台东原生种植物。