公元1815年（清嘉庆20年），下淡水县丞吴性诚为了振兴地方文教风气，与岁贡生郭萃、林梦阳等人起议兴建屏东书院（又称孔庙），虽然书院经过多次的迁移整修，但仍然维持原有的讲堂、祀殿及斋舍格局，充份呈现传统书院的空间特色，是屏东历史悠远的建筑的古迹，也是屏东境内唯一的书院建筑。 屏东书院最早起建在今日的中山公园内，共有36间斋舍，前殿设讲堂，后殿奉祀文昌帝君、程子与周子等诸人；公元1895年（光绪21年），便将屏东书院改为孔庙，主祀孔子，配祀孟子、颜子、思子、曾子四大贤人，以及周子、朱子、程颐、程颢、张子五大儒者，但在缺乏经费修缮的情形下，孔庙就逐渐荒废了。 公元1937年，统治台湾的日本人计划将孔庙迁往他处，但在日本学者疾呼保存的建议之下，便按照书院的原貌拆迁至胜利路现址，然而迁移新址之后，曾有很长一段时间，因未积极维护，使孔庙又呈现破旧景况。 直到1977年，当时的屏东县长延请知名建筑师汉宝德先生主持修复计划，1979年终于使孔庙恢复当年旧观。修建后的孔庙，庭院面积挪宽，前后殿以轩亭相连，中堂改为大成殿，后殿改为崇圣祠，附建单坡迥廊，并加筑一面照壁，上书「九仞宫墙」；另外还保留四座碑记，以呈现书院的修筑历程。1985年，屏东书院被列为国家三级古迹，是深具文化价值并保持完好的历史古迹。