中日战争期间,日人在南京掠走玄奘大师的顶骨舍利,供奉在日本崎玉县慈恩寺, 1955年 ,始将部分顶骨舍利归还佛教会,并择定暂时安奉于日月潭畔之玄光寺;1965年11月,玄奘寺落成后,灵骨才迎奉入玄奘寺。