斗六市「行启记念馆」的设立，源自于日治时期裕仁皇太子（后来的昭和天皇）「台湾行启记念」的事宜。日本天皇巡视称作「行幸」，而由皇太子、皇后等其它人巡视称作「行启」。 

大正十二年（1923）四月十二日裕仁皇太子由日本横须贺军港搭乘军舰出发，十六日抵台并展开视察，二十七日离台。裕仁皇太子离台后，台湾总督府为纪念皇太子视察台湾之事迹，于五月十八日成立「皇太子殿下台湾行启记念事业调查委员会」，而台湾各地也陆陆续续展开记念活动，分别设立行启记念碑或行启记念馆，而斗六记念馆即为当时设立的馆舍之一。