斗六市「行启记念馆」的设立,源自于日治时期裕仁皇太子(后来的昭和天皇)「台湾行启记念」的事宜。日本天皇巡视称作「行幸」,而由皇太子、皇后等其它人巡视称作「行启」。
大正十二年(1923)四月十二日裕仁皇太子由日本横须贺军港搭乘军舰出发,十六日抵台并展开视察,二十七日离台。裕仁皇太子离台后,台湾总督府为纪念皇太子视察台湾之事迹,于五月十八日成立「皇太子殿下台湾行启记念事业调查委员会」,而台湾各地也陆陆续续展开记念活动,分别设立行启记念碑或行启记念馆,而斗六记念馆即为当时设立的馆舍之一。