台南市在17世纪以前，是台湾平地原住民西拉雅族的生活领域。而自17世纪时荷兰东印度公司以大员为其国际贸易据点、赤崁为行政以来，历经荷兰统治、明郑时期、清领时期，台南市为成为岛内首府达300余年。17世纪，荷兰东印度公司人员抵达时，今台湾西南部仍为成群罗列的洲舄海岸，称为台江内海。舄湖外侧有北线尾与大员等沙洲岛屿，内陆则有原住民赤崁社。台江内海两岸彼此隔海约4千米、深3至14米。台南市发展成为城市系由荷兰人之手。荷人稍后于大员建立热兰遮城，作为全岛统治中心。荷人亦向赤崁方面的原住民购地，兴建普罗民遮城（今赤崁楼）并规画市街。